Detektion von SARS-CoV-2 (Coronavirus) für Forschungszwecke

05.03.2020

Überblick über den SARS-CoV-2-Nachweisprozess (Coronavirus)

Im Dezember 2019 wurde in Wuhan, der Hauptstadt der chinesischen Provinz Hubei, der SARS-CoV-2 (ehemals 2019-nCoV) identifiziert. Aufgrund seiner raschen Ausbreitung mit mehr als 950.000 bestätigten Fällen bis Anfang April 2020 erklärte die Weltgesundheitsorganisation den Ausbruch zu einem öffentlichen Gesundheitsnotstand von internationaler Bedeutung.

Wichtige Fakten:

  • SARS-CoV-2: (+) ss-RNA-Virus
  • Verwandt mit SARS-CoV und MERS-CoV
  • Nachweis auf der Basis von PCR

Analytik Jena bietet ein breites Produktportfolio im Bereich der Nukleinsäureextraktion und PCR bzw. Real Time PCR mit sowohl Extraktionskits als auch erforderlichen Geräten an. Für Forschungzwecke zum Nachweis des SARS-CoV-2 wird folgender Workflow vorgeschlagen.

1. Probennahme

Prinzipiell eignet sich Atemmaterial wie Nasen-Rachen- und Oropharynxabstrichproben für den Nachweis respiratorischer Erreger. Für nähere Informationen sind Empfehlungen der WHO oder sonstiger Institutionen zu beachten.
Weiterhin kann Serum für serologische Tests, Akutproben und Rekonvaleszenzproben genutzt werden.

 

2. Nukleinsäure-Extraktion

Analytik Jena bietet eine Auswahl an Extraktionsplattformen und zugehörigen Extraktionskits zur Extraktion viraler RNA aus Abstrichen, zellfreien Körperflüssigkeiten (z.B. Serum, Plasma, Liquor) und mehr. Die Produktlinie innuPREP AniPath ermöglicht die gleichzeitige Extraktion von bakterieller und viraler DNA und/oder RNA aus den jeweiligen Ausgangsmaterialien. Eine detaillierte Übersicht ist in der folgenden Tabelle dargestellt.

HandhabungProbendurchsatzExtraktionsplattformExtraktions-Kit
NameWichtige Merkmale
ManuellNiedrig
 
-Bis zu 12 Proben / 25 mininnuPREP Virus TS RNA Kit

 

Automatisiert

MittelInnuPure C16 touch

Bis zu 16 Proben / 31 - 84 min

Extraktionsplattform

innuPREP AniPath DNA/RNA Kit - IPC16
innuPREP Virus DNA/RNA Kit - IPC16 (MDX)*
innuPREP Virus DNA/RNA Kit - IPC16
HochCyBio FeliX

Bis zu 96 Proben / 62 - 73 min

Extraktionsplattform + Liquid Handling

(z.B. Vorbereitung der PCR)

innuPREP AniPath DNA/RNA Kit – FX**
innuPREP Virus DNA/RNA Kit - FX
Hoch
 
KingFisher Flex

Bis zu 96 Proben /  60 min

Ausschließlich Extraktionsplattform

innuPREP AniPath DNA/RNA Kit - KFFLX
innuPREP RNA Virus PLUS Kit (MDX) – KFFLX *
innuPREP RNA Virus PLUS Kit – KFFLX

* CE IVD-Kits nur in Deutschland erhältlich
** Einführung geplant für 30. April 2020

3. Vervielfältigung und Detektion

Molekulare Assays zum Nachweis von SARS-CoV-2 sind über die Homepage der WHO zugänglich. Darüber hinaus sind mehrere kommerzielle Real-time PCR-Kits erhältlich:

  • TIB MOLBIOL: Lightmix® MODULAR WUHAN CoV RdRP-Gene (bestätigte Kompatibilität mit qTOWER³) 

  • TIB MOLBIOL: Lightmix® MODULAR SARS AND WUHAN CoV E-Gene (bestätigte Kompatibilität mit qTOWER³) 

  • TIB MOLBIOL: Lightmix® MODULAR SARS AND WUHA CoV N-Gene (bestätigte Kompatibilität mit qTOWER³) 

  • R-Biopharm: RIDA®GENE SARS-CoV-2 RUO

  • PrimerDesign: Coronavirus (COVID-19)

  • Procomcure Biotech: PhoenixDx® 2019-nCoV RNA Detection Kit

Das PCR-Set kann mit einer Liquid-Handling-Plattform wie dem CyBio FeliX pipettiert werden. Die Verwendung einer PCR-Workstation oder -Kabinett bietet maximale Sicherheit und minimiert das Kontaminationsrisiko. Einzelne Komponenten wie Reverse Transkriptase sind ebenfalls über Analytik Jena erhältlich. Generell können alle Real-Time PCR-basierten Assays auf Real-Time Thermocyclern, wie etwa der qTOWER3-Familie von Analytik Jena, durchgeführt werden. Weitere Informationen werden bereitgestellt, sobald die Test mit ausgewählten Kits erfolgt und die Ergebnisse verfügbar sind.

Bitte beachten Sie, dass alle hier aufgeführten Produkte der Analytik Jena AG soweit nicht explizit als CE-IVD gekennzeichnet, ausschließlich für Forschungszwecke bestimmt sind.

Downloads

Flyer Workflow detection of SARS-CoV-2 (English)

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